بدأ فؤاد الخوري مسيرته كمصوّر فوتوغرافي منتجاً صوراً من الحياة اليومية خلال الحرب الأهلية اللبنانية. وثّق الإجتياح الإسرائيلي لبيروت عام 1982 ووجد نفسه على متن "أطلنتيس"، السفينة التي استخدمت لترحيل ياسر عرفات، ما ساهم في إنتاج مشروع تصوير بحري غير متوقّع. إنضم الى وكالة "رافو" في العام 1989 وأمضى سنة في مصر. في العام 1991، كان عضواً في مشروع تصوير مشترك منوط به إلتقاط صورة مثلى للدمار في وسط مدينة بيروت مع روبرت فرانك، ريمون ديباردون، ريني بوري، جوزيف كوديلكا وغابرييل بازيليكو. هو واحد من مؤسسي المؤسسة العربية للصورة وهي جمعية غير ربحية تعمل على جمع وحفظ ودراسة الصور من الشرق الأوسط وشمال أفريقيا والمجتمعات العربية في بلاد المهجر.